Adanya pandemi Covid-19 membawa dampak yang menyeluruh, tidak terkecuali bagi dunia pendidikan. Ditiadakannya pertemuan tatap muka dan diterapkannya protokol kesehatan sebagai antisipasi penyebaran covid-19 memaksa insan pendidikan harus tetap kreatif dan inovatif di tengah keterbatasan ruang dan waktu. Untuk tetap bergerak progresif di tengah pandemi, Prodi S3 PAI FITK UIN Sunan Kalijaga menyelenggarakan seminar nasional melalui media online atau disebut juga webinar nasional. Webinar nasional ini diadakan sebagai sarana bagi mahasiswa doktoral PAI untuk dapat meningkatkan publikasi ilmiah dengan menjadi narasumber webinar. Webinar nasional ini juga merupakan wujud nyata Prodi S3 PAI untuk memperkuat MoU kerjasama antara UIN Sunan Kalijaga dengan PTKI di seluruh Indonesia, yaitu dengan mengundang para pakar dari perguruan tinggi yang telah menjalin kerjasama sebagai narasumber utama webinar. Untuk dapat mewadahi partisipasi aktif dari mahasiswa doktoral PAI maka webinar nasional diselenggarakan dalam lima series, dengan tema dan waktu pelaksanaan sebagai berikut:

Webinar Nasional S3 PAI Series #1

Tema: Revitalisasi Pendidikan Agama Islam Memasuki Era New Norm dan Era Revolusi Industri 4.0

Pelaksanaan: Selasa, 28 Juli 2020 Pukul 09.00 – 12.00 WIB

Webinar Nasional S3 PAI Series #2

Tema: Paradigma dan Literatur Pemikiran Pendidikan Islam di Era Kontemporer

Pelaksanaan: Selasa, 11 Agustus 2020 Pukul 08.00 – 12.00 WIB

Webinar Nasional S3 PAI Series #3

Tema: Reformulasi Kurikulum Pendidikan Islam: Suatu Respon Merdeka Belajar

Pelaksanaan: Selasa, 18 Agustus 2020 Pukul 08.00 – 12.00 WIB

Webinar Nasional S3 PAI Series #4

Tema: Model Pembelajaran Pendidikan Agama Islam di Era New Norm

Pelaksanaan: Selasa, 25 Agustus 2020 Pukul 08.00 – 12.00 WIB

Webinar Nasional S3 PAI Series #5

Tema: Pendidikan Akal dan Akhlak di Era New Norm

Pelaksanaan: Selasa, 1 September 2020 Pukul 08.00 – 12.00 WIB

Webinar series diselenggarakan secara streaming melalui media aplikasi zoom dan juga live streaming youtube S3 PAI UIN Suka channel. Webinar nasional ini gratis biaya pendaftaran dan dibuka untuk umum dengan target peserta meliputi mahasiswa, guru, dosen, peneliti, praktisi pendidikan, serta siapa saja yang tertarik dengan Perkembangan Pendidikan Agama Islam di Indonesia baik dari lingkup nasional maupun internasional. Setiap peserta yang hadir dalam webinar akan mendapatkan e-sertifikat dan materi dari para narasumber. Dengan diselenggarakannya webinar nasional ini diharapkan dapat mewujudkan visi dan misi prodi serta memperluas jangkauan Prodi S3 PAI FITK UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta untuk berperan aktif dalam mengembangkan Pendidikan Agama Islam.